維吾爾族古代信仰過薩滿教、摩尼教、景教、祆教和佛教。
10世紀中葉喀喇汗朝薩圖克·布格拉汗歸信伊斯蘭教后，喀什噶爾、葉爾羌、和闐地區改奉伊斯蘭教。
13世紀初阿克蘇、庫車、焉耆地區維吾爾人改奉伊斯蘭教。
14世紀時，天山北路伊犁、塔城等地區維吾爾人改奉伊斯蘭教。
公元10世紀末至16世紀初，吐魯番、哈密等東疆地區維吾爾人改奉伊斯蘭教。
當前，維吾爾族多數信仰伊斯蘭教，多屬于遜尼派。

一日食三餐，早飯吃馕和各種瓜果醬、甜醬，喝奶茶、油茶等，午飯是各類主食，晚飯多是馕、茶或湯面等。以面食為主，喜食牛、羊肉。主食的種類有數十種。最常吃的有馕、羊肉抓飯、包子、面條等。 維吾爾族喜歡飲茯茶、奶茶。夏季多伴食瓜果。 新疆盛產綿羊，由此維吾爾族便有了烤羊肉串的習俗。講究的羊肉串肉質鮮嫩，味咸辣，孜然的特殊味濃郁。 與羊肉串相媲美的手抓飯，也是維吾爾族的傳統風味食品。在新疆維吾爾、烏孜別克等民族地區，逢年過年，婚喪娶嫁的日子里，都必備抓飯待客。他們的傳統習慣是請客人圍坐在桌子旁，上面鋪上一塊干凈的餐巾。隨后主人一手端盤，一手執壺，逐個讓客人凈手，并遞給干凈毛巾擦干。然后主人端來幾盤抓飯，置餐巾上（習慣是二至三人一盤），請客人直接用手從盤中抓吃，故取名為“抓飯”。維吾爾族抓飯的種類很多，花色品種十分豐富。

維吾爾族待客和作客都有講究。如果來客，要請客人坐在上席，擺上馕、各種糕點、冰糖等，夏天還要擺上一些瓜果，先給客人倒茶水或奶茶。待飯做好后再端上來，如果用抓飯待客，飯前要提一壺水，請客人洗手。吃完飯后，由長者領作“都瓦”，待主人收拾食具完，客人才能離席。吃飯時，客人不可隨便撥弄盤中食物，不可隨便到鍋灶前去，一般不把食物剩在碗中，同時注意不讓飯屑落地，如不慎落地，要拾起來放在自己跟前的“飯單”上。共盤吃抓飯時，不將已抓起的飯粒再放進盤中。

客人不能東張西望或立起。飯前飯后必須洗手，洗后只能用手帕或布擦干，忌諱順手甩水，認為那樣不禮貌。