一 政治制度上的爭端，新加坡國父李光耀是個積極的反社會主義制度的人，這也是為何新加坡長時間與臺灣關系較好的原因。二 領海上的爭端。新加坡糾集了東南亞五個國家，聯合了西方強國，在我國南海領域進行股份制石油開采，對我靠近漁民無禮進行扣押。三 自由貿易協定實行上的爭端。四 對于中國在新馬之爭中新加坡一直認為中方偏向馬來西亞，也有爭端。五在美國是否更多的參與亞洲各項事務上的爭端

中新之間沒有領土爭端，但是新加坡奉行中立政策，但是和英美靠得比較近，和臺灣關系不尋常，雖然新加坡支持一個中國政策，新加坡是美國利益在亞洲的代表者之一，所以中國與新加坡政府之間存在摩擦是正常的，但這并不代表中新兩國人民就不友善，廣東福建人，祖上很多人民國初年移民去新加坡等東南亞國家，有些親戚現在很有來往。只能說兩國關系微妙，當中國對美國不滿的時候，會拿新加坡出氣，美國對中國不滿的時候，會讓新加坡出來挑恤中國。 另外，海峽兩岸關系史上最關鍵的第一次汪辜會談就是在新加坡舉行的，新加坡充當了調停人的角色。而且隨著中國地位的提高，中國與新加坡貿易往來相當密切，大陸吸引新加坡的投資，新加坡需要大陸的勞務輸出，另外新加坡開始允許建設賭場就是為了吸引中國的富人旅游觀光