由于地域關系和歷史原因，閩南端午習俗在延續中華民族傳統習俗的同時，也保留了各自獨特的民風習俗，形成了形態各異、豐富多彩的民俗活動。
福建省民俗學會常務副會長石奕龍教授說，閩南過端午共同的習俗有三類：一類是驅毒、驅蟲、避邪類，如端午節午時用蘭草水洗浴、炒鹽作為午時鹽、采草藥作為午時茶；一類是吃堿粽子、發糕等端午儀式食品；一類是劃龍舟，兼有中原文化和海洋文化的特點。
閩南各地還有各自獨特的端午習俗。據介紹，泉州端午節有很多祈福消災習俗，包括門楣插“五瑞”（即五種植物）、小孩胸佩香袋、泡雄黃酒、炒午時鹽等。另外還有一種諧趣的驅邪消災的習俗叫“采蓮”，采蓮隊伍中有鋪兵、鑼鼓陣、花童或男扮女裝的提花婆，由一位扮相邋遢不堪、手舉長桿幡旗的“醉漢”充當前導，最后由四人抬著一具木雕龍頭壓陣，為沿途的民眾入室舞旗拂掃。
漳州市詔安縣數百年來走“貢王”的民俗為當地鄉親喜聞樂見。每逢端午節，當地鄉人分別從兩廟中抬沈世紀、李伯瑤二將的神像出行，環繞北關游街時，由廟宇燈籠前導，刀斧戈戟羅列雙行，社眾排隊隨后，齊唱原名龍船鼓歌的“貢王歌”，十分熱鬧。清代進士黃開泰有一首《端陽走貢王竹枝詞》記其盛況：“滿城競唱貢王歌，結隊游街鼓伴鑼。端午舁神因底事？開漳英烈績難磨?！?br>廈門市的端午習俗也熱鬧非凡，據清道光年間的《廈門志》記載：“五月五日，端午懸蒲、艾、榕枝于門，粘符制采勝及粽相饋遺。競渡于海濱……或十余日乃止?！绷硗猓宋缙陂g，廈門還有民間傳統競技活動“抓鴨子”，競技場設在水面上，參加者要走過一根涂滿滑油的圓木柱，然后打開一只盛鴨子的木箱，再跳進水里去抓掉下去的鴨子。